我國林業科學家日前完成了包括毛竹葉片、筍和萌發種子等在內的毛竹全長互補DNA文庫構建,并精確測定了1萬余條基因序列。這是公共數據庫中繼模式植物水稻(單子葉)和擬南芥(雙子葉)以外,第三大植物全長互補DNA數據信息資源,取得了林業領域基因組學研究的重大突破。第一次提供了大量竹亞科基因序列信息,填補了禾本科植物比較基因組學研究空白,為進一步開展基因組測序計劃提供了有效的基因注釋依據。 毛竹全長互補DNA文庫構建和基因序列精確測定,是"毛竹基因組測序研究"重大科研項目的第一部分。該項目由財政部、科技部支持,國家林業局行業科研專項立項重點支撐,中國林業科學研究院、國際竹藤網絡中心與中國科學院國家基因研究中心合作承擔。 科學家們在完成毛竹全長互補DNA文庫構建并精確測定1萬余條基因序列的同時,還首次根據毛竹大規模的基因序列統計了毛竹基因的一些基本信息,包括鳥嘌呤+胞嘧啶含量(GC含量)、密碼子使用偏好性、簡單重復序列、小分子核糖核酸和轉座子的統計等。另外,科學家們根據鑒定到的42組禾本科同源基因,進行了系統發育樹分析,分析顯示毛竹與水稻具有最近的進化關系。這為禾本科植物的進一步研究提供了極其重要的信息,是林業領域基因組學研究的一個重大突破。 同時,作為大規模開展毛竹基因組測序的關鍵性基礎研究工作,科學家們還順利完成了兩套高質量、高覆蓋率的毛竹細菌人工染色體文庫構建工作,為全面開展毛竹基因組測序研究的各項預研工作做好了準備。 毛竹是世界上最重要的竹類植物之一,也是我國分布范圍最廣、種植面積最大、經濟價值最高的竹種,在禾本科植物中占有特殊的地位。而禾本科類植物是人類獲取食物和潛在可再生能源的主要來源。為了進行更全面的比較基因組學的研究,科學工作者需要不斷積累來自于不同種類的禾本科植物的基因信息和基因組信息。目前,在公共數據庫中,禾本科的大多數亞科(超過100個種類)都有大量相應的基因組信息或表達信息,只有竹亞科(包含約1000多個種類)僅有少量的序列信息。毛竹全長互補DNA文庫構建的完成和1萬余條基因序列的精確測定填補了這一方面的空缺。
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